朱怀球

2019-08-20 15:23:40 2

 

朱怀球

 

博士生导师

 

电话:010-62767261
电子信箱:hqzhu_at_pku.edu.cn

 

1992年本科毕业于华中理工大学(现华中科技大学)力学系工程力学专业;

1997年硕士毕业于北大力学系流体力学专业;

2000年博士毕业于北大力学系流体力学专业。

 

担任职务:

北京大学定量生物学中心教授;

北京大学工学院生物医学工程系副主任。

 

 

研究方向:

生物信息学,计算系统生物学

 

 

研究兴趣:

基因组复杂结构信息分析(原核和真核生物基因预测相关问题)、比较基因组学、生物进化以及生物分子动力学等。近年来主持发展的原核基因翻译起始位点预测方法MED-Start/MED-StartPlus、原核生物基因组分析和基因预测方法MED 2.0等目前已经达到国际同类方法的领先水平,并应用于法国原子能委员会(CEA Cadarche)、美国华盛顿大学(Washington Univ.)医学院等多个实验室的微生物基因组研究,得到国际生物信息学领域的关注。与美国Georgia Institute of Technology生物医学工程系相关实验室保持良好的合作关系。研究结果已在《Nucleic Acids Res.》、《Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《BMC Genomics》等生物信息学领域国际权威刊物发表,累计SCI影响因子总和超过50

 

 

工作经历:

200102年北大湍流与复杂系统国家重点实验室博士后,开始转入生物信息学的交叉学科研究;

20031月留校任教;

2006年加入北大工学院生物医学工程系;

2007.92008.8期间赫尔辛基大学芬兰基因组中心访问学者。

 

 

代表性论文:

1.       Chengwei Luo, Gang-Qing Hu, Huaiqiu Zhu, Genome reannotation of Escherichia coli CFT073 with new insights into virulence, BMC Genomics, 2009, 10: 552.

2.       Hong Kang, Xin-Qiu Yao, Zhen-Su She, Huaiqiu Zhu. Water-protein interplay reveals the specificity of alpha-lytic protease. Biochem. Bioph. Res. Co., 2009, 385: 165-169.

3.       Gang-Qing Hu, Xiaobin Zheng, Yi-Fan Yang, Philippe Ortet, Zhen-Su She, Huaiqiu Zhu. ProTISA: a comprehensive resource for translation initiation site annotation in prokaryotic genomes. Nucleic Acids Res., 2008, 36: D114-119.

4.       Huaiqiu Zhu, Gang-Qing Hu, Yi-Fan Yang, Jin Wang, Zhen-Su She. MED: a new non-supervised gene prediction algorithm for bacterial and archaeal genomes. BMC Bioinformatics, 2007, 8: 97.

5.       Huai-Qiu Zhu, Gang-Qing Hu, Zheng-Qing Ouyang, Jin Wang, Zhen-Su She. Accuracy improvement for identifying translation initiation sites in microbial genomes. Bioinformatics, 2004, 20(18): 3308-3317.

 

 

学术兼职

Int. J. Comput. Intelligence in Bioinformatics and Systems Biology (IJCIBSB)》副主编,中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会委员。