涂豫海

2020-01-03 09:55:03 39

 

涂豫海

博士生导师

电话:010-62759711 
电子信箱:yuhai_at_us.ibm.com

1983年进入中国科技大学少年班学习;

1987年通过CUSPEA考试进入美国加州大学圣地亚哥分校物理系读研究生;

1991年获得物理学博士学位。

 

担任职务:

美国IBM T. J. Watson Research Center研究员;

北京大学定量生物学中心杰出访问教授。

 

研究方向:

非平衡统计物理,非线性动力学,生物物理,系统生物学

 

研究兴趣:

非平衡统计物理在生物学中的应用,生物网络(生化分子网络和神经网络)中的信息处理


工作经历:

1991-1994年获得物理学博士学位后,成为美国加州理工学院部门奖研究员;

1994年加入IBM T. J. Watson研究中心做研究员,2003-2015年曾任该中心理论与计算物理实验室主任;

涂豫海博士由于在统计物理理论及其在计算生物学中的创新性应用方面的杰出贡献于2004年当选为美国物理学会会士(APS Fellow)

涂豫海博士由于发展开创性的聚飞理论(Flocking Theory)及开辟活性物质 (Active Matter) 这一新领域等重要供献荣获2020年APS 昂萨格奖(Lars Onsager Prize)


代表性文章:

1.  “The energy cost and optimal design for synchronization of coupled molecular oscillators”, D.Zhang, Y. Cao, Q. Ouyang, Y. Tu, Nature Physics, (2019) doi:10.1038/s41567-019-0701-7.

2.  “Optimal compressed sensing strategies for an array of nonlinear olfactory receptor neurons with and without spontaneous activity”, S. Qin, Q. Li, C. Tang, Y. Tu, PNAS, 116(41), 20286-20295 (2019).

3.  “The escape band in Escherichiacoli chemotaxis in opposing attractant and nutrient gradients”, X.Zhang, G. Si, Y. Dong, K. Chen, Q. Ouyang, C. Luo, Y. Tu, PNAS, 2019.

4.  “Adaptation in LivingSystems”, Yuhai Tu and Wouter-Jan Rappel, Annu. Rev. Condens. MatterPhys. 2018.9:183-205, 2018.

5.  “Information Processing in Bacteria: Memory, Computation, and Statistical Physics: A Key IssuesReview”, Ganhui Lan, Yuhai Tu, Reports on Progress in Physics, 79(5), pp. 52601-52617, 2016.

6.  “The free-energy cost of accurate biochemical oscillations”, Yuansheng Cao, Hongli Wang, Qi Ouyang, and Yuhai Tu, Nature Physics, 11, 772, 2015.

7.  “Discovery of Novel Chemoeffectors and Rational Design of E. coli Chemoreceptor Specificity”, S. Bi, D.Yu, G. Si, C. Luo, T. Li, Q. Ouyang, V. Jakovljevic, V. Sourjik, Yuhai Tu, and L. Lai, Proc. Natl. Acad.Sci. USA (PNAS), 2013, doi:10.1073/pnas.1306811110.

8.  “Quantitative Modeling of BacterialChemotaxis: Signal Amplification and Accurate Adaptation”, Yuhai Tu, Annu.Rev. Biophys. 2013. 42: 337-59.

9.  “A Pathway-basedMean-field Model for Escherichia coli Chemotaxis”, G. Si, T. Wu, Q. Ouyang, Yuhai Tu, Phys. Rev. Lett. (PRL), 109,048101-048105, 2012.

10.  “The energy-speed-accuracy trade-off in sensory adaptation”, G. Lan, P. Sartori, S. Neumann, V. Sourjik, and Yuhai Tu, Nature Physics 8, 422–428, 2012.

11.  “Dynamics of the bacterial flagellar motor with multiple stators”, G. Meacci and Yuhai Tu, PNAS, 106(10), 3746-3751 (2009).

12.  “Modeling the chemotactic response of E. coli to time-varying stimuli”, Y. Tu, T. S. Shimizu and H. Berg, PNAS, 105(39), 14855-14860 (2008).

13.  “The nonequilibrium mechanism for a biological switch: Sensing by Maxwell’s demons”, Y. Tu, PNAS, 105(33), 11737-11741 (2008).

14.  “Effects of adaptation in maintaining high sensitivity over a wide range of backgrounds for E. coli chemotaxis”, B. Mello and Y. Tu, Biophysical Journals, 92(4), 2329-2337 (2007).

15.  “How white noise generates power-law switching in bacterial motors”, Y. Tu and G. Grinstein, PRL, 94, 208101(2005)